2007年6月17日上午，随着杨贵泉副院长把中国新疆农业职业技术学院与马来西亚史丹福学院合作办学2006级留学生班的牌匾交到马来西亚史丹福学院院长Mr. Andrew手中，标志着学院第二批46名学生即将赴马来西亚史丹福学院留学。
　　学院顺应国际合作办学发展的趋势，于2004年12月成立国际合作学院，积极与马来西亚等国家和地区的大学联系、洽谈，建立了良好的合作和交流关系，引进对外合作办学的新形式。2005年6月，经自治区人民政府、自治区教育厅批准成立《中外合作办学机构》，通过进一步的接洽，与马来西亚史丹福学院签订了合作办学协议。
　　学院与马来西亚进行国际文化交流，目的是让新疆农职院的学生享受马来西亚史丹福学院的教育资源，培养国际型的人才，为学生铺设走向世界的发展道路。
　　学院与马来西亚史丹福学院合作采取“1+2”办学模式，即学生在新疆农职院学习一年的基础英语课程，对学生强化英语语言教学，采用双语授课形式展开教学，按合作方的考核要求与质量监控体系实施管理；后两年在马来西亚史丹福学院完成专业课程，通过考试后颁发经两国认可的双学历。
　　学院第二届中——马合作班，共有学生46人，他们经过在新疆农职院的两个学期的学习，完成了马来西亚史丹福学院课程体系中规定的两门专业课程以及英语语言的强化训练，将于6月20、22日赴马来西亚史丹福学院进行两年留学生活，继续学习其他专业课程。这是继2006年8月以来，新疆农职院与史丹福学院合作办学取得的第二次成果。
　　46名学生全部顺利办理出国手续（包括护照及签证），成功出国留学，这在新疆是史无前例的。
　　学院成功输送第二批学生赴马来西亚留学，为学院进一步快速发展，成功实施三大战略奠定了基础。海外留学生的成功输送扩大了新疆农职院的办学影响力，为今后进一步拓宽合作办学领域创造了更多的便利。